利用超级集群分离分析法鉴别大豆增变基因
2016-10-20分类号:Q943.2;S565.1
【部门】南阳师范学院农业工程学院
【摘要】【目的】利用大豆基因组Wm82.a2.v1及Hapmap数据来鉴别大豆中可能存在的增变基因。【方法】将大豆Hapmap数据(包含19 652份大豆种质在52 041个位点上的分型结果)预处理后,利用改进的超级集群分离分析法,选取滑动窗口大小、步长及阈值大小为参数,对预处理后的大豆种质数据进行分析,测算大豆点突变比率及突变热点区数目,并将点突变比率及突变热点区数目与分子标记进行关联性分析,从强关联区内挖掘候选增变基因,用大豆基因组Wm82.a2.v1对其功能进行初步推测。【结果】大豆Hapmap数据预处理后,15 391份大豆种质点突变比率为0.089~0.531,平均变异率为0.261;突变热...
【关键词】大豆 突变热点 增变基因 超级集群分离分析 nudix水解酶基因
【基金】南阳师范学院科研基金项目(ZX2015012)
【所属期刊栏目】西北农林科技大学学报(自然科学版)
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