草莓轻型黄边病毒外壳蛋白抗原表位预测
2016-12-28分类号:S436.68
【部门】兰州理工大学生命科学与工程学院 甘肃启明星节能科技有限公司
【摘要】抗原表位是抗体识别并结合抗原的部位。抗原表位的预测有助于重组抗原的设计、快速筛选和高活性抗原的快速制备。通过DNAStAr、Ex PASy、tMHMM SEvEr2.0和IEDB等软件对草莓轻型黄边病毒的外壳蛋白的二级结构、理化及生物学性质进行了分析。分析结果显示,草莓轻型黄边病毒的外壳蛋白中不存在跨膜区域;平均亲水性为-0.252,属于可溶性蛋白;潜在的抗原表位有5个,平均抗原指数为0.026 5~0.077 3。预测的上述5个抗原表位是否有抗原活性及其活性强弱仍有待于相应的试验论证。
【关键词】草莓轻型黄边病毒 外壳蛋白 抗原表位 结构预测
【基金】甘肃省科技计划项目(1504WKCA020); 甘肃启明星节能科技有限公司; 国家大学生创新创业训练项目(DC2015085)
【所属期刊栏目】华北农学报
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