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亚麻纤维素合酶超基因家族的生物信息学及表达分析

2016-12-02分类号:S563.2

【作者】袁红梅  郭文栋  赵丽娟  于莹  吴建忠  张利国  程莉莉  赵东升  吴广文  关凤芝  
【部门】黑龙江省农业科学院经济作物研究所  黑龙江省科学院自然与生态研究所  黑龙江省农业科学院作物育种研究所  
【摘要】【目的】全基因组水平鉴定亚麻纤维素合酶超家族基因Ces A/Csls,并对基因的进化、基因结构及组织表达特性等进行分析,为亚麻纤维发育的机理研究奠定基础。【方法】利用Phytozome基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定亚麻纤维素合酶超基因家族成员,并进行蛋白理化特性分析;利用meGA 5.0、GsDs、meme等软件构建系统进化树,并进行基因结构、蛋白保守基序分析;根据RNA-seq数据对Ces A/Csls进行表达分析。【结果】系统分析鉴定了45个亚麻Ces A/Csls超家族基因,该家族基因在sCAffolDs上是分散分布的,没有明显的成簇现象。Ces A/Csls蛋白主要分布于质膜上...
【关键词】亚麻  纤维素合酶  CesA/Csls  基因家族  表达分析
【基金】国家博士后面上项目(2014M560275); 黑龙江省博士后项目(LBH-Z13181); 哈尔滨市科技局创新人才项目(2013RFQYJ162); 国家麻类产业技术体系(CARS-19-S03)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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