越橘EST-SSR分子标记的开发及其遗传多样性分析
2016-10-20分类号:S663.9
【部门】吉林农业大学园艺学院 沈阳农业大学园艺学院
【摘要】【目的】探讨越橘EST序列中SSR位点的分布规律,开发越橘EST-SSR引物,并分析其在越橘品种遗传多样性研究中的作用。【方法】以91份越橘种质为材料,利用越橘果实转录组(RNA-SEq)的测序结果,通过SSRIT在线搜索,利用PRImER PREmIER 5.0软件设计30对引物,并筛选扩增效果理想的引物,用筛选出的引物分析91份种质的多态性,构建91份种质的系统发育树。【结果】34 464条越橘uNIgENE序列中含有SSR位点的序列有829条,SSR位点有913个,其中二核苷酸、三核苷酸重复是主要的SSR类型,分别占全部SSR位点的13.69%和81.27%。不同核苷酸数目重复基元的重复...
【关键词】越橘 EST SSR 遗传多样性
【基金】国家自然科学基金项目(31301755); 教育部博士点基金项目(20132223120004); 人事部留学人员科技活动择优资助项目; 吉林省科技发展计划项目(20150414047GH)
【所属期刊栏目】西北农林科技大学学报(自然科学版)
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