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基于紫娟茶叶片转录组的SSR引物开发

2016-12-28分类号:S571.1

【作者】周萌  宋维希  鄢文光  李晓霞  陈继伟  夏丽飞  梁家斌  陈林波  
【部门】云南省农业科学院茶叶研究所  云南省茶树种质资源创新与配套栽培技术工程研究中心  
【摘要】以稀有茶树品种紫娟茶为研究对象,进行SSR引物开发的研究,从紫娟茶叶片转录组中筛选重复基元最多的SSR,设计并筛选紫娟茶的SSR引物。通过从已测序的紫娟茶叶片转录组中设计SSR引物共87对,通过对紫娟茶以及随机采摘的3份不同品种茶树提取DNA后进行PCR扩增,1%琼脂糖凝胶电泳分析,在紫外凝胶成像仪中观察拍照,判断是否扩增出目标条带。通过试验筛选出可以扩增出清晰目标条带的引物63对,有效率达72.4%,其中有33对表现出多态性,占有效SSR引物的52.4%。结果表明,从紫娟茶叶片转录组中设计引物是可行的。下一步研究将从这63对引物中开发紫娟茶的特异引物。
【关键词】紫娟茶  SSR  引物开发
【基金】云南科技厅重大专项(2013BB006); 国家自然科学基金项目(31460216;31560200); 云南省农业科学院专项基金项目(YAAS2014JC012); 云南省人才培养计划项目(2015HB105)
【所属期刊栏目】华北农学报
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