【摘要】高校新财务制度和新会计制度的实施，对于提升高校财务管理水平、提高教育经费使用效益、促进高校健康发展将发挥积极作用，同时，也必然对高校内部审计工作产生影响。本文分析了新财务会计制度对高校内部审计职能、类别、内容等方面的影响，提出高校内部审计应主动适应制度变化，积极探索新制度下审计内容、审计方式的转变，以充分发挥内部审计在高校发展中的作用。