豆科植物查尔酮合成酶基因密码子偏好性分析
2016-12-28分类号:Q943.2
【部门】西南交通大学生命科学与工程学院
【摘要】查尔酮合成酶(ChalCone synthase,Chs)是参与合成植物苯丙烷类物质的主要酶类之一。研究豆科植物Chs基因密码子的偏好性,对提高豆科植物Chs基因的表达水平具有重要意义。为此,运用ChIPs、CUsP和Codon W程序分析豆科植物Chs基因密码子的偏好性,并用决明Chs基因对分析结果的可信度进行验证。结果表明,在豆科植物Chs基因的密码子中,以a或U结尾的密码子偏好性较强。基于Chs基因RsCU值的聚类结果显示,豆科植物与茄科植物(包括烟草)聚为一类,表明烟草作为研究豆科植物Chs基因功能的模式植物较为合适。通过对决明Chs基因密码子偏好性与大肠杆菌和酵母基因组密码子偏好性的...
【关键词】豆科植物 查尔酮合成酶 密码子偏好性 聚类分析
【基金】国家自然科学基金项目(31371232;31500276); 成都市科技技术研发项目(2015-HM01-00051-SF); 西南交通大学校级大学生创新创业训练计划资助项目(151607)
【所属期刊栏目】华北农学报
文献传递