基于RNA-Seq的稻瘟病菌ΔzNf1突变体的表达谱分析
2016-09-02分类号:S435.111.41
【部门】浙江大学农业与生物技术学院水稻生物学国家重点实验室
【摘要】【目的】稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)引起的水稻稻瘟病是威胁全球水稻生产的重要病害之一,而该菌附着胞介导的侵染又是病害循环的重要环节。在前期的研究中发现一个编码C_2h_2锌指结构的转录因子基因znF1,参与稻瘟病菌附着胞形成、穿透和致病过程,论文旨在从转录水平上了解受znF1调控的基因及其调控机理,为深入研究稻瘟病菌致病分子机理提供基础数据。【方法】利用rna-Seq技术对稻瘟病菌野生型菌株guy11和突变体ΔznF1的营养菌丝体进行表达谱测序,采用FpKM法计算基因表达量,以FDr≤0.001且log2 ratio(ΔznF1/guy11)≥1为筛选标准,获得ΔznF1中...
【关键词】水稻 稻瘟病菌 附着胞 Δznf1 RNA-Seq 差异表达基因
【基金】国家重点基础研究发展计划(“973”计划)(2012CB114002); 国家自然科学基金(31370172)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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