甘蓝枯萎病抗性基因FOC1序列分析及抗性相关变异位点分析
2016-06-28分类号：S436.35
【部门】甘肃农业大学园艺学院 北京市农林科学院蔬菜研究中心农业部华北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室 中国农业科学院蔬菜花卉研究所
【摘要】旨在发掘甘蓝抗枯萎病基因ＦＯＣ１中与抗性相关的特异性单核苷酸多态性（ＳＮＰ），为进一步开发ＦＯＣ１特异分子标记提供理论依据。在对１１份甘蓝自交系材料枯萎病抗病表型鉴定基础上，通过基因测序，对每份材料中ＦＯＣ１等位基因及相应的氨基酸序列变异进行分析。结果表明，ＦＯＣ１等位基因序列之间共存在９２处ＳＮＰ变异和２处ＩＮｄｅｌ变异，其中包含Ｃ３８１Ａ／Ｇ等１８个在抗、感材料中表现出特异性差异的ＳＮＰＳ。此１８个特异的ＳＮＰ中转换型比率为８６．１１％、颠换型比率为１３．８９％，４种碱基变异率以Ｔ／Ｃ、Ｇ／Ａ最高，分别占４７．２２％和３８．８９％，而Ｃ／Ｇ和Ａ／Ｃ变异率共占１３．８９％。本研究也发现抗、感．．．
【关键词】甘蓝 抗枯萎病 特异SNP 序列分析
【基金】“十二五”国家科技支撑计划项目(2012BAD02B01;2014BAD01B08); 北京市科委项目(Z141105002314020)
【所属期刊栏目】华北农学报
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