蓝细菌16S rrNA双甲基化酶基因kSgA的进化分析、蛋白结构预测及功能验证
2016-10-24分类号：Q93
【部门】华中农业大学农业微生物学国家重点实验室
【摘要】为研究核糖体小亚基ｒｒＮＡ双甲基化酶基因ｋｓｇＡ的进化关系、蛋白结构和功能，利用ＭＥｇＡ ５．２软件构建了３７种蓝细菌ｋｓｇＡ基因和１６ｓｒＤＮＡ的系统进化树，通过ｓＷＩｓｓ－ＭＯＤＥＬ分析和预测ｋｓｇＡ的蛋白质结构模型，并通过克隆集胞蓝细菌ｓｙＮＥｃｈＯｃｙｓｔＩｓ ｓｐ．ｓｔｒＡＩＮ ｐｃｃ ６８０３、鱼腥蓝细菌ＡＮＡｂＡＥＮＡ ｓｐ．ｓｔｒＡＩＮ ｐｃｃ７１２０和聚球蓝细菌ｓｙＮＥｃｈＯｃＯｃｃｕｓ ＥＬＯＮｇＡｔＥｓ ｓｐ．ｓｔｒＡＩＮ ｐｃｃ ７９４２的ｋｓｇＡ基因对大肠杆菌ｋｓｇＡ突变体进行了异源互补。结果表明：ｋｓｇＡ基因在蓝细菌中与１６ｓｒＤＮＡ进化分支高度相似，且体现出蓝细菌．．．
【关键词】ksgA 蓝细菌 双甲基化修饰 序列分析 蛋白结构预测 SWISS-MODEL
【基金】国家自然科学基金项目(31570048); 中央高校基本科研业务费专项(2014PY003)
【所属期刊栏目】华中农业大学学报
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