假黄单胞菌株J1的筛选及木质纤维素降解基因的生物信息学分析
2016-07-30分类号:Q93
【部门】南京农业大学生物信息学中心/生命科学学院
【摘要】[目的]本研究旨在发掘木质纤维素降解菌种资源,并寻找木质纤维素降解关键酶基因和代谢通路。[方法]以纤维素为唯一碳源,从土壤、腐叶混合物中分离出27株具有纤维素降解能力的细菌。通过测定纤维素酶活力,将降解效果最优菌株进行全基因组测序。通过与同属细菌的全基因组序列的比对构建贝叶斯树。[结果]菌株J1内切纤维素酶、滤纸酶和β-葡萄糖苷酶活力峰值分别为0.39、0.18和0.11 IU·m L~(-1),并将菌株J1鉴定为假黄单胞菌(PseUdoxanthomonas sP.)。CLUsters of orthoLogoUs groUPs(Cog)和Carbohydrate-aCtIve enzyme...
【关键词】木质纤维素 假黄单胞菌属 细菌基因组 生物信息学 生物乙醇
【基金】
【所属期刊栏目】南京农业大学学报
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