ssc-miR-486靶基因预测及生物信息学分析
2016-10-28分类号：Q811.4;R589.2
【部门】中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
【摘要】通过对ｓｓｃ－ｍｉＲ－４８６进行靶基因预测及生物信息学分析，以探索其影响猪脂肪沉积的作用机制。首先利用实时荧光定量ＰｃＲ技术对脂肪沉积能力相差较大的莱芜猪和大白猪皮下脂肪组织中ｓｓｃ－ｍｉＲ－４８６表达情况进行比较研究，然后利用ｍｉＲＢａｓｅ、ｅｎｓｅｍＢｌ、ｎｃＢｉ等数据库及ｍｉＲａｎｄａ、ＰｉＴａ、ＲｎａｈｙＢＲｉｄ、ｃｙＴｏｓｃａＰｅ、ＪａｓＰａＲ、ＰＲｏｍｏＴｅＲ ｓｃａｎ等软件对ｓｓｃ－ｍｉＲ－４８６进行生物信息学分析，包括保守性分析、转录因子结合位点预测、靶基因预测、Ｇｏ富集分析和ＫｅＧＧ信号通路富集分析。结果表明，ｓｓｃ－ｍｉＲ－４８６在脂肪沉积能力较强的莱芜猪皮下脂肪组织中发生．．．
【关键词】ssc-miR-486 生物信息学 脂肪沉积 猪
【基金】转基因生物新品种培育科技重大专项(2009ZX08008-004B;2008ZX08008-003); 国家“863”计划项目(2008AA10Z140); 国家自然科学基金项目(30571339); 中国农业科学院农业科技创新项目(ASTIP-IAS05);中国农业科学院创新基金项目(2004-院-1); 国家重点基础研究发展计划(“973”计划项目)(2015CB943100); 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(2013ywf-yB-5;2013ywf-Zd-2)
【所属期刊栏目】华北农学报
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