水稻颖花开放前浆片转录组变化
2016-03-18分类号:S511
【部门】江西农业大学农学院/作物生理生态与遗传育种教育部重点实验室/江西省作物生理生态与遗传育种重点实验室 宜春学院生命科学与资源环境学院
【摘要】【目的】水稻颖花开放是由其基部的一对浆片吸水膨大所启动。测序技术的发展为从细胞整体水平研究浆片对颖花开放的分子响应,从而对掌握浆片调控颖花开放的内在分子机制提供更为快速、有效的方法。【方法】以常规籼稻品种中早25为材料,应用IllumIna测序技术对水稻颖花开放前12 h和临开放前1 h 2个时间点的浆片转录组进行测序,将所得高质量的序列(clean reads)与籼稻9311参考序列比对,获得唯一比对上某一参考基因匹配的reads(unIque reads),采用rPKm法计算基因表达量,并在此基础上以Fdr≤0.001和|log2ratIo|≥1为条件筛选出两样本间差异表达的基因,通过与g...
【关键词】水稻 浆片 颖花开放时间 转录组 Illumina测序
【基金】国家自然科学基金(31360297); 江西省“赣鄱英才555工程”领军人才培养计划; 江西省科技支撑计划(20111BBF60009)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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