【摘要】针对已公布的１８个甘蔗花叶病毒（ＳＣＭＶ）全基因组序列，利用ＭＥＧＡ ５．１分析了其１１个蛋白（Ｐ１、ＨＣ－Ｐｒｏ、Ｐ３、６Ｋ１、ＣＩ、６Ｋ２、ＶＰＧ、ＮＩＡ－Ｐｒｏ、ＮＩｂ、ＣＰ－Ｃ和多聚蛋白）编码基因所受的选择压，并结合其编码蛋白的功能，预测了部分基因在ＳＣＭＶ进化过程中的角色和变异位点．结果显示：Ｐ１和ＣＰ－Ｎ端的变异性程度较大，Ｐ１蛋白多样性最高；ＣＰ－Ｃ端变异性和多样性均较低；ＰＩＰｏ受到的选择压最小，但多样性最低，可能是由于ＰＩＰｏ与Ｐ３共用一段编码序列．来源于甘蔗的ＳＣＭＶ多聚蛋白的第２ ８５３、２ ８９７和２ ９０４个氨基酸位点（在ＣＰ中部）分别为Ｔ、ｒ和Ｅ，而来源于玉米的ＳＣ．．．