类重金属ATP酶基因序列遗传变异分析
2016-10-11分类号：S511
【部门】云南农业大学农学与生物技术学院 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所 云南省农业生物技术重点实验室 农业部西南作物基因资源与种质创新重点实验室 中国科学院昆明动物研究所
【摘要】ＯｓＨＭＡ２是水稻根和地上部一个主要的Ｚｎ和Ｃｄ的转运蛋白，在水稻基因组ＯｓＨＭＡ２位点存在ＯｓＨＭＡ２类似基因ＯｓＨＭＡ２－ｌｉｋｅ，编码蛋白包含水稻Ｐ１Ｂ型ＡＴＰ酶重金属转运蛋白的功能域。对来自世界不同稻区的２７份亚洲栽培稻和８份野生稻基因ＯｓＨＭＡ２－ｌｉｋｅ编码区序列进行了测序分析，以了解水稻ＯｓＨＭＡ２－ｌｉｋｅ序列的多样性，为发掘基因资源提供信息。ＯｓＨＭＡ２－ｌｉｋｅ核苷酸序列和氨基酸序列分析表明，在４７１ＢＰ的编码序列内发现了６个变异位点；ＴＡｊｉＭＡ＇ｓｄ检验表明均不显著，说明这些位点属中性进化状态；６个变异位点中，第１５、７８、１３２、２１４、４１７位点碱基不引起氨基酸的变．．．
【关键词】亚洲栽培稻 野生稻 OsHMA2-like基因 进化
【基金】国家自然科学基金“抗稻瘟病基因Pid2进化与专化抗性分子机制研究”(31360331); 科技部基础性工作专项“贵州农业生物资源调查”(2012FY110200); 云南省自然科学基金“云南地方稻种Pi-d2同源基因序列及专化抗性分子机制研究”(2013FZ146)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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