马铃薯青枯菌Po82菌株质粒基因组分泌蛋白信号肽的分析
2016-05-31分类号：S432.4
【部门】农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室 云南生物资源保护与利用国家重点实验室
【摘要】应用计算机技术和生物信息学的方法，采用Ｓｉｇｎａｌ Ｐ４．０、ｌｉＰｏ Ｐ１．０、ＴａｒｇｅＴ Ｐ１．０．１、ＴＭＨＭＭ２．０蛋白质分析软件对植物病原细菌ｒａｌＳＴｏｎｉａ ＳｏｌａｎａｃｅａｒｕＭ Ｐｏ８２质粒基因组的１６８０个ｏｒＦＳ编码的分泌蛋白信号肽氨基酸序列进行预测分析。结果表明，质粒基因组的１６８０个ｏｒＦＳ中有１０２个ｏｒＦＳ所编码的蛋白质具有ｎ－端信号肽序列，包括８５个Ⅰ型信号肽，１个Ⅱ型信号肽，１５个ＰｒｅＰｉｌｉｎ－ｌｉｋｅ信号肽和１个细菌素和信息素信号肽，所有的分泌蛋白中具有ｒｒ－ＭｏＴｉＦ信号肽结构的有１４个，且均为Ⅰ型信号肽。在１０２个具有可切割信号肽的分泌蛋白中，有．．．
【关键词】生物信息学 青枯病 分泌信号肽 质粒基因组
【基金】公益性行业(农业)科研专项经费项目“作物细菌性病害防控技术研究与示范”(201303015)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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