【摘要】项目成本核算是企业界普遍运用的经济核算方法，把项目成本核算运用到医院是一个创新，对医院有非常重要的意义，但在运用的过程中发现北京市属医院使用的计算机软件系统核算出来的手术费用与实际情况有很大出入，故在此阐述北京市属医院使用的计算机软件系统造成手术项目成本脱离实际的成因，应该采取的办法，希望开发软件的公司找到更好的解决办法，为医疗机构提供更为准确的成本数据，进一步深化医改工作。