柑橘全爪螨微卫星位点鉴定与信息分析
2016-01-26分类号:S436.66
【部门】西南大学植物保护学院
【摘要】【目的】通过磁珠富集法构建柑橘全爪螨(Panonychus citri)微卫星富集文库,发掘柑橘全爪螨基因组微卫星(g ssr)序列。同时,利用柑橘全爪螨转录组数据库,筛选其功能微卫星(Est-ssr)分子标记,设计柑橘全爪螨微卫星(ssr)引物并验证其适用性。【方法】在提取柑橘全爪螨高质量基因组Dna的基础上,使用链霉亲和素偶联的磁珠与生物素标记的微卫星探针结合,亲和性捕捉由限制性内切酶酶切产生的含ssr的单链基因组Dna目的序列,经Pcr扩增为双链后,克隆并构建ssr富集文库,测序筛选ssr序列。另一方面,基于柑橘全爪螨转录组数据,利用msatcommanDEr软件发掘其功能微卫星标记。采...
【关键词】柑橘全爪螨 叶螨科 高通量测序 分子标记 微卫星富集文库
【基金】国家自然科学基金(31171851,31301667); 中央高校基本科研业务费(XDJK2015B034,2362015XK04)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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