尖孢镰刀菌甜瓜专化型基因组规模分泌蛋白的预测与分析
2016-04-29分类号：S436.5
【部门】华南农业大学材料与能源学院 华南农业大学农学院/广东省微生物信号与作物病害重点实验室
【摘要】利用Ｓｉｇｎａｌ Ｐ、Ｗｏ ｌＦ ＰＳｏＲＴ、ＴＭＨＭＭ、ｂｉｇ－Ｐｉ ＰＲｅｄｉｃＴｏＲ、ＴａＲｇｅＴ Ｐ和ＳｅｃＲｅＴｏＭｅ Ｐ等软件，对尖孢镰刀菌甜瓜专化型（ＦｕＳａＲｉｕＭ ｏｘｙＳＰｏＲｕＭ Ｆ．ＳＰ．ＭｅｌｏｎｉＳ，ＦｏＭ）全基因组２６ ８１１条蛋白质氨基酸序列进行了分泌蛋白的预测分析。结果表明，ＦｏＭ全基因组编码蛋白中有１ １４５个经典分泌蛋白，占编码蛋白总数的４．３％；有８ ４７１个非经典分泌蛋白，占编码蛋白总数的３１．６％。对经典分泌蛋白特征进行分析，发现其氨基酸长度集中在１００～６００个氨基酸，信号肽长度集中在１７～２２个氨基酸。对经典分泌蛋白的功能预测分析表明，有６０５个．．．
【关键词】尖孢镰刀菌甜瓜专化型 分泌蛋白 信号肽 碳水化合物酶类 蛋白功能预测
【基金】国家自然科学基金项目(30971887); 广东省普通高校青年创新人才项目(粤教科函[2015]3号)
【所属期刊栏目】华中农业大学学报
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