苹果bZIP转录因子家族生物信息学分析及其在休眠芽中的表达
2016-03-31分类号：S661.1;Q943.2
【部门】山东农业大学园艺科学与工程学院/国家苹果工程技术研究中心/作物生物学国家重点实验室/山东果蔬优质高效生产协同创新中心
【摘要】【目的】鉴定苹果（Ｍａｌｕｓ×ｄｏＭｅｓｔｉｃａ Ｂｏｒｋｈ．）基因组上的Ｂ ＺｉＰ基因（ＭｄＢＺｉＰ），为研究苹果ＢＺｉＰ转录因子提供相关信息以及在芽休眠过程中的调控作用提供理论参考。【方法】通过ＰｆａＭ下载ＢＺｉＰ隐马尔科夫模型ＢＺｉＰ＿１（Ｐｆ００１７０）与ＢＺｉＰ＿２（Ｐｆ０７７１６），利用ｈＭＭｅｒ ３．０鉴定苹果ＢＺｉＰ基因。使用ｃｌｕｓｔａｌ ｏＭｅｇａ、Ｍｅｇａ６．０、ＭａＰ ｉｎｓＰｅｃｔ、ｄｎａＭａｎ ６．０和ＭｅＭｅ４．１０．２等软件对其蛋白序列进行生物信息学分析。采用Ｍｉｃｒｏａｒｒａｙ分析与ｑｒｔ－Ｐｃｒ技术检测苹果ＢＺｉＰ基因在不同处理下及其在高需冷量品种与低需冷量．．．
【关键词】苹果 bZIP转录因子 芽休眠 进化树分析 序列对比 Microarray分析 qRT-PCR
【基金】国家自然科学基金(31372050); 山东省自然科学基金(ZR2014CM015)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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