陆地棉EPSPS基因全基因组分析
2016-02-28分类号：S562
【部门】江苏省农业科学院农业部长江下游棉花和油菜重点实验室
【摘要】当前在ＮＣＢＩ中提交的来源于陆地棉的ＥＰＳＰＳ基因有２个，随着陆地棉基因组测序结果的公布，为在陆地棉基因组中全面鉴定ＥＰＳＰＳ基因的存在提供了便利条件。从陆地棉异源四倍体标准系ＴＭ－１基因组数据库中共搜寻获得４个ＥＰＳＰＳ同源基因，这４个基因分别分布在Ａ０７、Ａ１２、Ｄ０７和Ｄ１２亚基因组。从这４个基因的核苷酸序列、氨基酸序列和基因结构的比对，构建进化树的系统发育分析以及基因的转录情况研究来看，定位在Ａ０７和Ｄ０７亚基因组的２个基因属于共线性高度同源基因，定位在Ａ１２和Ｄ１２亚基因组的２个基因也是相同的情况。序列比对结果表明，已经在ＮＣＢＩ中提交的２个ＥＰＳＰＳ基因分别是定位在Ａ１２和Ｄ１２亚．．．
【关键词】陆地棉 陆地棉基因组 EPSPS基因
【基金】国家自然科学基金项目(31301682); 江苏省农业科技自主创新基金项目(CX(14)5009); 国家转基因重大专项(2013ZX08005)
【所属期刊栏目】华北农学报
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