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温州蜜柑果实贮藏寿命生物标记的筛选

2016-03-31分类号:S666

【作者】孙力  丁毓端  何义仲  陈玲玲  程运江  
【部门】华中农业大学园艺林学学院/园艺植物生物学教育部重点实验室/农业部华中地区园艺作物生物学与种质创新重点实验室  华中农业大学信息学院/华中农业大学生物信息学中心  
【摘要】【目的】对温州蜜柑果实贮藏期所处生理状态进行分析,挖掘能反映柑橘果实采后贮藏期所处不同生理阶段的生物标记。【方法】通过对温州蜜柑采后贮藏0—50 d的基因芯片数据和初生代谢物数据分析,结合聚类、主成分分析、偏最小二乘法判别分析和支持向量机等机器学习的方法挖掘能够预测温州蜜柑果实贮藏寿命的生物标记,并采用qRT-PCR对标记的可靠性进行验证。【结果】基于多元差异比较分析筛选出了5 232个差异基因;并将采后温州蜜柑分为贮藏初期、中期和后期3个生理阶段。MaPMan功能富集分析发现氨基酸代谢和细胞壁代谢与采后温州蜜柑所处的生理状态密切相关;基因本体富集分析表明核小体组装、蛋白酶解等生物过程也发生了...
【关键词】温州蜜柑  果实贮藏  生物标记  基因芯片  初生代谢物
【基金】国家科技支撑计划(2015BAD16B06); 华中农业大学自主创新基金; 现代农业产业技术体系(CARS-27); 国家公益性行业(农业)科研专项(201303093)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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