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11条白桦BpSpL家族基因的生物信息学和表达分析

2016-10-15分类号:S792.153

【作者】宁坤  杨洋  马述山  李慧玉  
【部门】林木遗传育种国家重点实验室东北林业大学  
【摘要】[目的]研究白桦中SPL转录因子的基因序列特征及其在不同时期不同组织中的表达规律。[方法]依据白桦45个转录组测序结果,共获得12条全长SPL基因,依次命名为白桦BPSPL1-BPSPL12,对其中11条BPSPL进行了生物信息学及基因表达特征分析。[结果]生物信息学分析发现,11条BPSPL均含有1个高度保守的SBP结构域,且基因长度差异较大,含有2 10个不等数目的外显子,系统进化分析发现11条白桦SPL分属于六大类SPL蛋白;qRT-PCR分析结果显示,白桦BPSPL基因在不同时期的叶、顶芽、茎、雄花序中表达变化显著,多数SPL基因在顶芽中7月5日和8月20日至9月20日时期表达较高,除...
【关键词】白桦  BpSPL基因家族  生物信息学  基因表达
【基金】“十二五”农村领域国家科技计划课题—“水曲柳和白桦珍贵用材林定向培育技术研究与示范”(2012BAD21B02)
【所属期刊栏目】林业科学研究
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