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长白落叶松小RNA测序和其靶基因预测

2016-12-15分类号:S791.22

【作者】张素芳  张磊  赵佳丽  张莉  张含国  
【部门】东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室  
【摘要】miRNA是近年来新发现的一种比较特殊的具有高度保守的小RNA,其在基因调控网络中扮演着重要的角色。本文借助illumiA测序平台,经过SolexA测序分析,对长白落叶松的miRNA进行了分析,最终筛选出了15 294 797条cleAN ReAdS。比对结果显示,除去核糖体RNA(RRNA)2 991 972条、转运RNA(tRNA)65 264条、核内小RNA(SNRNA)1 670条、核仁小RNA(SNoRNA)467条等NcRNA以及重复序列6 421条,共获得未获得注释的miRNA12 229 003条,占总注释小RNA的79.96%。利用miRdeep2对未注释的小RNA进行miR...
【关键词】小RNA  长白落叶松  miRNA  靶基因
【基金】“863”国家高技术研究发展计划项目(2013AA102704); 中央高校基本科研业务费专项(2572016CA08;2572016AA36)
【所属期刊栏目】北京林业大学学报
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