青杨4CL基因的克隆及生物信息学分析
2016-07-26分类号：S792.113
【部门】西南科技大学植物细胞工程实验室 四川省生物质资源利用与改性工程技术研究中心
【摘要】４ＣＬ是木质素合成途径中的关键酶，对其进行生物信息学分析，为深入研究４ＣＬ的作用奠定基础并为进一步改良青杨提供理论支撑。以青杨嫩茎为试材，采用ＲＴ－ＰＣＲ方法克隆青杨４ＣＬ基因，使用ＮＣＢＩ、ＤＮＡＭＡＮ及Ｅｘ ＰＡＳｙ等一系列在线软件及工具，对青杨４ＣＬ基因的编码区、氨基酸序列及蛋白质的结构和功能进行生物信息学分析。克隆了青杨４ＣＬ基因，命名为ＰＣ４ＣＬ（ＧＥＮ ＢＡＮｋ注册号：ｋＪ４９０６３６）。该基因全长１６２３ ＢＰ，开放阅读框为１～１６１１ ＢＰ，编码５３６个氨基酸，含有４ＣＬ的保守域ＳＳＧＴＴＧＬＰｋＧＶ和ＧＥＩＣＩＲＧ及催化活性残基ＨＩＳ－２３４。ＰＣ４ＣＬ与ＰＴ Ｃ４ＣＬ同源性．．．
【关键词】青杨 4CL基因 克隆 生物信息学分析
【基金】国家自然科学基金青年基金项目(31400257,31400333); 四川省“十二五”重点公关资助项目(2011YZGG-10); 四川省应用基础研究基金资助项目(2013JY0182); 四川省生物质资源利用与改性工程技术研究中心基金资助(12Zxsk07,13Zxsk01)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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