葡萄OVATE基因家族生物信息学及表达
2016-10-10分类号:S663.1
【部门】南京农业大学园艺学院
【摘要】【目的】OVATE是一类调控植物生长发育的转录抑制因子,对葡萄OVATE基因家族(VV OFPs)进行生物信息学和组织特异性表达分析,为该类基因的功能研究奠定基础。【方法】根据OVATE保守域蛋白序列(PF04844)对葡萄OVATE基因家族进行鉴定,利用生物信息学方法对葡萄OVATE基因家族染色体定位、基因结构、保守结构域、亚细胞定位等方面进行预测和分析,并分析葡萄和拟南芥OVATE基因家族的进化关系。采用实时荧光定量PCR技术检测VV OFPs组织表达特性。【结果】葡萄OVATE基因家族包含17个成员,不均匀地分布在11条染色体上,均没有内含子结构,编码115—444个氨基酸,等电点4.5...
【关键词】葡萄 OVATE基因家族 生物信息学 表达
【基金】国家现代农业葡萄产业技术体系项目(CARS-30); 国家“948”重点项目(2016-X19); 淮安科技局葡萄新品种引进及设施栽培技术研究与应用项目(HAC2014019); 江苏省科技厅设施条件下葡萄高效栽培新技术研究与应用项目(SBE2014030811)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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