【摘要】【目的】从全蛋白质组学水平研究烟草，筛选具有重要特性的蛋白质，阐明其相关代谢通路，使得烟草的基础科学研究和品种培育工作有所突破。【方法】利用苯酚法提取中国３个主栽烟草品种红花大金元、Ｋ３２６和云烟８７叶片的蛋白质，酶解后采用串联质量标签技术（ｔａｎｄｅｍ ｍａｓｓ ｔａｇ，ｔｍｔ）标记，结合二维液相色谱串联质谱技术（２ｄ ＬＣ－ｍｓ／ｍｓ）对３个烟草品种叶片的蛋白质组成进行分析，运用Ｐｒｏｔｅｏｍｅ ｄｉｓＣｏｖｅｒｅｒ软件提取谱图后在ｍａｓＣｏｔ搜索引擎上鉴定蛋白质和肽段，并对鉴定的蛋白质进行系统的生物信息学分析，包括数据相关性分析、分层聚类分析和主成分分析，同时按照２倍上下调的原则采用火山．．．