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杜仲幼果和叶片MVA途径基因表达差异分析

2016-04-07分类号:S567.19

【作者】王淋  乌云塔娜  叶生晶  
【部门】中国林业科学研究院经济林研究开发中心  国家林业局杜仲工程技术研究中心  国家林业局中南林业调查规划设计院  
【摘要】【目的】杜仲橡胶是一种多萜类物质,而甲羟戊酸(MVA)途径是合成萜类物质的重要途径之一。分析杜仲MVA途径相关基因表达的差异,预测杜仲橡胶合成的主要上游途径。【方法】在杜仲幼果和叶片转录组测序的基础上,根据基因功能注释和表达分析,确定MVA途径的系列基因,并对其进行表达差异分析。【结果】杜仲橡胶合成的MVA途径共涉及23条Unigene,分别为3条eUACOT、3条eUHMgS、8条eUHMgR、2条eUMK、1条eUPMK和6条eUMDP基因。根据转录组RPKM(ReADS PeR KilO bASeS PeR MilliOn ReADS)数据对基因表达差异进行分析,结果表明杜仲MVA途径中...
【关键词】杜仲  幼果和叶片  甲羟酸途径  基因表达差异
【基金】国家林业公益性行业科研专项(201004029)
【所属期刊栏目】西北农林科技大学学报(自然科学版)
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