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杜仲Ref基因密码子偏好性分析

2016-04-07分类号:S567.19

【作者】刘慧敏  乌云塔娜  杜红岩  
【部门】中国林业科学研究院经济林研究开发中心  国家林业局杜仲工程技术研究中心  
【摘要】杜仲是世界上唯一的硬橡胶树种,是能够替代三叶橡胶的最具开发潜力的胶源植物。本研究以杜仲胶合成下游途径Ref基因为研究对象,运用Codon W和CUSPS等研究Ref基因的密码子组成特点及使用偏好性。研究结果表明,杜仲Ref基因的GC含量为49%,密码子第三位碱基的GC含量为59%;杜仲Ref基因有28个偏好使用的密码子,其中约60%(17个)的密码子以G/C结尾;与大肠杆菌、酵母、拟南芥和烟草的基因组密码子使用偏好性比较,杜仲与拟南芥基因组密码子的使用偏性更为接近,拟南芥更适合作为Ref转基因的受体。本研究为预测杜仲Ref基因的异源表达,适宜表达系统的选择以及Ref基因密码子的改造以提高其在宿...
【关键词】杜仲  Ref基因  密码子  偏好性
【基金】国家林业公益性行业科研专项(201004029)
【所属期刊栏目】中南林业科技大学学报
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