大豆HGm1 Helitron转座元件的鉴定与生物信息学分析
2016-07-30分类号:S565.1
【部门】南京农业大学园艺学院/作物遗传与种质创新国家重点实验室 江苏省农业科学院农业生物技术研究所/江苏省农业生物学重点实验室
【摘要】[目的]helitron转座元件是近年来发现的一种结构新颖和转座方式独特的DnA转座子。我们从全基因组水平上对大豆基因组中拷贝数最多的helitron hGm1家族进行深入分析,旨在为后续进一步明确helitron转座元件在大豆及其近缘种基因和基因组演化中所起的作用提供帮助。[方法]利用基因组学和生物信息学的研究手段,我们对大豆hGm1家族的数量、结构特征、染色体分布、插入基因情况,基因片段的捕获及表达模式等进行了详细的研究。[结果]从公开发表的大豆基因组序列中共鉴定出254个hGm1转座元件。这些元件的3'末端十分保守,主要由GC含量较高的碱基组成。hGm1元件主要分布在At丰富的区域,并在...
【关键词】大豆 helitron转座元件 分布 插入 捕获 转录
【基金】国家自然科学基金项目(31370266); 江苏省“333”人才工程项目(BRA2013267); 江苏省农业科技自主创新基金项目[CX14(5010)]
【所属期刊栏目】南京农业大学学报
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