梁山慈竹UGP基因克隆与生物信息学分析
2016-03-16分类号：S795.5
【部门】西南科技大学植物细胞工程实验室 四川省生物质资源利用与改性工程技术研究中心
【摘要】以梁山慈竹笋为材料，采用ＲＴ－ＰＣＲ方法克隆梁山慈竹ＵＧＰ基因，对梁山慈竹ＵＧＰ基因的编码区、氨基酸序列及蛋白质的结构和功能进行生物信息学分析。获得１个梁山慈竹ＵＧＰ基因，命名为Ｄｆ ＵＧＰ（Ｇｅｎｅｂａｎｋ：ｋＪ５２５７５２）。测序结果显示该序列全长１５６１ ｂＰ，包含一个完整的ＯＲｆ框，长度为１４２２ ｂＰ，编码４７３个氨基酸。梁山慈竹ＵＧＰ基因与巨龙竹、绿竹、水稻、大麦、玉米、甘蔗的具有高度的同源相似性，编码的蛋白结构较为相似，均含有ｎ端区域、中心区域和Ｃ端区域，且蛋白三级结构中都具有ｎｂｌＯＯＰ环和ｌ－ｌＯＯＰ环。Ｄｆ ＵＧＰ具有ｎ端的ＵＤＰＧＰ功能域，其位于第９０～３７９氨基酸，证明．．．
【关键词】梁山慈竹 UGP 克隆 生物信息学
【基金】国家自然科学基金青年基金项目(31400257;31400333); 四川省“十二五”重点公关资助项目(2011YZGG-10); 四川省应用基础研究基金资助项目(2013JY0182); 四川省生物质资源利用与改性工程技术研究中心基金资助(12Zxsk07;13Zxsk01)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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