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不同生长势美洲黑杨转录组差异分析

2016-03-15分类号:S792.11

【作者】丁昌俊  张伟溪  高暝  黄秦军  褚延广  苏晓华  
【部门】林木遗传育种国家重点实验室国家林业局林木培育重点实验室中国林业科学研究院林业研究所  中国林业科学研究院亚热带林业研究所  
【摘要】【目的】研究美洲黑杨杂种F1的基因表达模式,从基因表达水平揭示杂种优势形成机制,为杨树杂种优势的深度开发利用提供有益参考。【方法】采用IllumIna HISeq 2000高通量测序技术对不同生长势美洲黑杨杂种F1(3个生长势超过双亲、2个生长势低于亲本)及其亲本进行转录组测序和差异比较。【结果】转录组测序共产生171 154 127条ReadS(平均长度200 bp,约31.32 Gb),将处理后ReadS与毛果杨参考基因组数据库比对,有61.89%的ReadS可以与参考基因组匹配。超亲杂种F1 VS亲本中筛选出342个基因显著差异表达(上调表达87个,下调表达255个);低亲杂种F1 VS...
【关键词】美洲黑杨  转录组  差异表达  杂种优势
【基金】国家“十二五”科技支撑计划课题(2012BAD01B03)
【所属期刊栏目】林业科学
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