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甘蔗细胞色素b6-f复合体铁硫亚基(SoCYT)基因的克隆和表达分析

2016-05-31分类号:S566.1

【作者】梁潘霞  李杨瑞  
【部门】广西农业科学院资源与环境研究所  中国农业科学院甘蔗研究中心/农业部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室/广西甘蔗遗传改良重点实验室  
【摘要】以甘蔗叶片总RNA为模板,通过RT-PCR扩增细胞色素b6-f复合体铁硫亚基基因的C DNA,采用生物信息学软件分析所克隆基因的编码蛋白特性,并用荧光定量PCR分析该基因的表达情况。结果表明:克隆得到的C DNA片段长度为796 bP,包括1个579 bP的开放阅读框,编码192个氨基酸。甘蔗与高粱CYT基因C DNA序列的同源性为94.0%,氨基酸序列同源性为99.0%;该基因推导的蛋白分子量大小为20.67KD,等电点为6.24,疏水性分值在0.50~2.11;蛋白二级结构中α-螺旋占17.19%,随机卷曲占53.12%,延伸链占21.53%,β-转角只占8.33%,GeN bANK登录号...
【关键词】甘蔗  细胞色素b6-f复合体铁硫亚基  克隆  生物信息学分析  表达
【基金】国家高技术研究计划(863计划)项目(2013AA102604); 科技部国际合作项目(2013DFA31600); 广西自然科学基金项目(2014GXNSFBA118139); 广西农业科学院基本业务专项项目(桂农2014YD13)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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