【摘要】在创新驱动基于市场和政府双引擎助推下使技术创新网络不断扩展的背景下，中国新能源汽车产业创新生态系统已初步形成。无论从社会生态学角度，还是从经济管理角度，现阶段都需要对新能源汽车产业创新生态系统进行补贴。本文对近年来的补贴政策进行了梳理与分析，发现政府补贴的重点与力度在不断发生变化。这里选定整车种群与零部件种群中的企业各一个，模拟分析了两企业在合作均衡与竞争均衡条件下的最优政府补贴问题，并得出结论：一是创新生态系统充分合作创新，政府补贴退出是完全可行的；二是政府补贴的重点应转向弱生态位种群，对于强生态位种群可以少补贴、不补贴、甚至负补贴。