【摘要】相对于一般法人企业而言，农民专业合作社的经营宗旨具有社会公平与经济效率的双重属性，从而决定了合作社治理机制的特殊性，也决定了评价其绩效不能简单套用企业评价标准。文章采用山东、河南、陕西三省１５３份农民专业合作社的调查数据，在构建基于平衡计分卡的合作社绩效评价体系的基础上，检验了农民专业合作社治理机制对其绩效的影响。研究结果表明：我国农民专业合作社的治理机制影响了其治理绩效。其中，农民专业合作社退出指数、外部理事比例、内部监督指数与农民专业合作社绩效正相关；农民专业合作社股权集中度与绩效负相关。在此基础上提出了相应的对策建议。