【摘要】文章全面梳理了深港科技创新合作历史与现状、合作所遇到的主要问题和障碍，指出目前普遍存在的认识、操作和制度三个层面问题。需要统一认识，利用两地税收和知识产权法律差异，发挥两种制度特长，利用两地地缘优势，选择海洋开发、生物医药、航空航天、文化创意等合作领域打开局面，做好合作各项基础工作。