基于胡鲇科和鲇科ESTS序列初步筛选兰州鲇EST-SSR分子标记
2015-04-27分类号：S917.4
【部门】甘肃农业大学动物科学技术学院 宁夏回族自治区水产研究所 宁夏渔业工程技术研究中心
【摘要】利用ＳＳＲＨｕｎｔｅＲ软件对现已公布的鲇形目（ＳｉｌｕＲｉｆｏＲｍｅＳ）中胡鲇科（ＣｌａＲｉｉｄａｅ）和鲇科（ＳｉｌｕＲｉｄｅａ）共２００２条ｅＳｔ（ｅｘｐＲｅＳＳｅｄ ＳｅｑｕｅｎＣｅ ｔａｇ）序列筛选兰州鲇（ＳｉｌｕＲｕＳ ｌａｎｚＨｏｕｅｎＳｉＳ）微卫星标记，并分析其序列丰度和分布特征。结果共发现２０９个微卫星序列，占整个ｅＳｔＳ数据库的１０．４４％；其中三碱基重复序列数量最多，占ｅＳｔＳ数据库中发现微卫星序列总数的３５．６２％；二、四、五、六碱基重复序列分别占微卫星序列总数的２８．３１％、２５．５７％、７．７６％、２．７４％。根据侧翼序列，设计１２５对引物，随机选取５８对进行扩增鉴定及．．．
【关键词】兰州鲇(Silurus lanzhouensis) 微卫星标记 表达序列标签(EST) 特征分析
【基金】国家自然科学基金项目(31360633); 宁夏对外科技合作项目
【所属期刊栏目】淡水渔业
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