基于Roche 454 GS FLX的钝吻黄盖鲽(PLeuRonecteS yokohamae)微卫星标记的开发
2015-02-15分类号：S917.4
【部门】上海海洋大学水产与生命学院 农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所 中国科学院海洋研究所 中国海洋大学水产学院
【摘要】利用Ｒｏｃｈｅ ４５４ ＧＳ ＦＬＸ平台测序技术进行了钝吻黄盖鲽微卫星引物筛选，并采用聚类分析的方法对得到的５６４１个微卫星位点进行类比分析，得到２４７种多态性位点，其中完美型占５２．２２％，非完美型占２０．２４％，复合型占２７．５４％，（Ａｃ）ｎ、（ＡＧ）ｎ两碱基重复类型的比例是４４％，重复次数在１０次以上的占总数的８７．５％。随机选取１１个位点的微卫星引物，采用５个野生个体，利用荧光标记和毛细管电泳进行多样性评价，４个位点偏离ｈＡＲｄｙ－ＷｅｉｎｂｅＲＧ平衡，不同位点得到的等位基因范围为３－８，平均等位基因数为５．０。平均观望杂合度（ｈｏ）、平均期望杂合度（ｈｅ）及平均多态性信息含量（Ｐｉ．．．
【关键词】Roche 454 GS FLX 钝吻黄盖鲽 开发 微卫星标记
【基金】国家科技基础条件平台项目(2006DKA30470-006)资助
【所属期刊栏目】渔业科学进展
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