鸟巢蕨EST-SSR标记的开发与应用
2015-12-28分类号:S682.35
【部门】江苏省农业科学院园艺研究所江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室
【摘要】为加速分子标记在鸟巢蕨研究中的应用,利用鸟巢蕨EST序列开展了EST-SSR标记的开发和应用研究。利用MISA软件对鸟巢蕨EST序列进行SSR位点查找,分析EST-SSR的总体特征,并利用PRIMER 3.0软件设计40对引物,选用10份蕨类材料检测引物的多态性。从42 907条鸟巢蕨EST序列中检测到6 067个SSR位点,其出现频率为1/6.62 kb,包括106种重复基元。在鸟巢蕨EST-SSR中,二核苷酸重复(2 873个,47.35%)是最主要的类型,其次是三核苷酸(1 107个,18.25%)和单核苷酸(972个,16.02%)。出现最多的重复基元是AG/TC(1 371个,22....
【关键词】鸟巢蕨 分子标记 EST-SSR
【基金】江苏省农业科技自主创新资金品种创新项目(CX(13)2044)
【所属期刊栏目】华北农学报
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