陆地棉GhZIP基因家族全基因组分析
2015-12-28分类号：S562;Q943.2
【部门】江苏省农业科学院农业部长江下游棉花和油菜重点实验室
【摘要】ＺＩＰ基因家族是生物体内非常重要的一类金属阳离子转运蛋白基因家族，通过对陆地棉基因组的全面分析和鉴定，获得ＧｈＺＩＰ基因家族系统性的生物学信息。运用比较基因组学的方法，从陆地棉异源四倍体标准系ＴＭ－１基因组数据库中鉴定出４５个ＧｈＺＩＰ基因，这些基因分布在除了Ａ０４、Ａ０９、Ｄ０４和Ｄ０９号亚基因组以外的２２个亚基因组，Ｄ亚组比Ａ亚组多５个ＧｈＺＩＰ基因，有１６对基因在Ａ亚组和相对的Ｄ亚组上存在一一对应关系。有４４个ＧｈＺＩＰ基因具有跨膜结构，其中有３６个ＧｈＺＩＰ基因的跨膜结构域是６～９个，具有ｈＩｓ富集区序列并位于膜内侧可变区的有２０个ＧｈＺＩＰ基因，只有１个ＧｈＺＩＰ基因亚细胞定位不在细．．．
【关键词】棉花 陆地棉基因组 GhZIP基因
【基金】国家自然科学基金项目(31301682); 江苏省农业科技自主创新基金项目(CX(14)5009); 国家转基因重大专项(2013ZX08005)
【所属期刊栏目】华北农学报
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