【摘要】本文运用中国各地区Ｒ＆Ｄ中政府资金投入面板数据，对政府投入效率进行测度和影响因素分析。效率测度结果表明：２０１３年Ｒ＆Ｄ中政府科技投入效率在地区间存在较大差异，但２００９年以来地区间效率差异在缩小；政府科技投入效率呈阶梯式分布，东部地区高于中西部地区；２００９年以来技术效率变化的正向贡献逐步被技术进步率的负向影响所抵消，目前制度和政策无法适应科技创新的需要，资源配置机制阻碍了效率提升；政府科技投入效率影响因素分析表明：研发投入强度、科研资源禀赋、科技创新市场环境和经济发展水平与政府科技投入效率正相关，政府科技投入的比重与效率负相关。最后，本文对提升中国政府科技投入效率提出了相关建议。