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756C中Ⅵ型分泌蛋白的生物信息学分析

2016-06-28分类号:S432.4

【作者】韩长志  王娟  
【部门】西南林业大学林学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室  云南省林业科学院/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室  
【摘要】为明确黄单胞菌Xanthomonascampestrispv.raphani756c(Xcr)中存在的Ⅵ型分泌蛋白(tss)数量及其所具有的信号肽、保守motif等信息以及该菌中tss与其他病菌中同源序列之间的遗传关系,利用关键词对Xcr蛋白质数据库进行搜索,并对Xcr中tss氨基酸序列开展信号肽、跨膜结构域以及保守基序(motif)的生物信息学分析,同时,对Xcr中所含有的tss与其他病原菌中同源序列之间的遗传关系进行分析.明确Xcr中存在3个tss,分别命名为tss a、tss B、tss c,上述tss均含有高于50%比例的a螺旋结构,均定位在细胞膜上以及具有3个保守motif,而就信号...
【关键词】Xanthomonascampestrispv.raphani756C  Ⅵ型分泌系统  Ⅵ型分泌蛋白  黄单胞菌属
【基金】
【所属期刊栏目】华中农业大学学报
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