【摘要】[目的]为了研究水稻籼粳交杂种优势的分子基础,[方法]利用Affymetrix水稻表达谱芯片分析了强优势籼粳交水稻组合“申9A/繁31”与母本“申9A”和父本“繁31”在幼穗分化初期剑叶组织的基因表达差异,并对差异表达基因进行了基于生物学过程的GO(Gene Ontology)功能分类和代谢通路分析。[结果]幼穗分化初期杂种与双亲的表型已经产生了明显差异;共有2258个基因在杂种与亲本之间差异表达(差异倍数≥2或≤0.5),杂种与双亲均显示差异表达的基因有327个,杂种与父本之间的差异表达基因远多于母本。杂种差异表达基因具有多种表达模式,具有正效应基因的增强表达和具有负效应基因的抑制表达对杂种...