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油桐尺蛾核型多角体病毒广西株全基因组序列

2015-10-15分类号:S763.306.4

【作者】罗辑  周国英  朱积余  
【部门】中南林业科技大学林学院  广西壮族自治区林业科学研究院  
【摘要】油桐尺蛾核型多角体病毒广西株基因组序列由Sanger测序的方法得到。拼接后获得了121 268 bp序列,GC含量为36.76%。以长度不小于50 aa的序列认定为功能基因,共预测到131个开放阅读框,通过Blast比对,其中87个能注释到功能基因。对基因组序列进重复序列分析,共发现SSR位点174个,同源重复序列1个。在SSR位点中,包含6种长度的重复基序,且以富含AT的重复基序为主。同源重复序列两端为一59 bp片段或其一部分组成的重复序列,两端分别重复12次和7次,中间则为一段与重复片段无关的236 bp片段。与武汉株相比,广西株病毒在37个核心基因中有4个存在蛋白序列长度上的差异,而在...
【关键词】油桐尺蛾  核型多角体病毒  株系  基因组  重复序列
【基金】国家自然科学基金项目(31400549); 中国博士后科学基金资助项目(2014M552533XB); 广西博士后专项资助项目; 广西林科院基金项目(林科201401号)
【所属期刊栏目】林业科学研究
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