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中华稻蝗羧酸酯酶家族基因生物信息学及组织表达特异性分析

2015-11-05分类号:S433.2

【作者】刘娇  张建珍  李大琪  张婷婷  马恩波  张建琴  
【部门】山西大学应用生物学研究所  山西大学生命科学学院  山西大学中医药现代研究中心  
【摘要】[目的]对重要农业害虫中华稻蝗(Oxya chinensis)羧酸酯酶(carboxylesterases,Ces)家族基因进行生物信息学分析,并对部分基因的组织表达特性进行研究,为揭示中华稻蝗Ces基因功能及研发新的分子靶标提供依据。[方法]基于中华稻蝗转录组数据库,通过关键词搜索获得Ces基因序列,采用生物信息学方法进行比对拼接、氨基酸序列推导和开放阅读框分析,选择全长序列构建系统发育树,采用在线软件分析中华稻蝗Ces氨基酸序列结构、理化性质、信号肽和N糖基化位点等特征。采用实时定量PCR技术,通过ge Norm与Normfinder软件分析4个候选内参基因β-肌动蛋白(β-actin)、...
【关键词】中华稻蝗  转录组  羧酸酯酶基因  生物信息学  组织特异表达
【基金】国家自然科学基金(31320103921,30870302); 山西省高等学校科技创新项目(2015119)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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