基于胡鲇科和鲇科ESTs序列初步筛选兰州鲇EST-SSR分子标记
2015-04-27分类号：S917.4
【部门】甘肃农业大学动物科学技术学院 宁夏回族自治区水产研究所 宁夏渔业工程技术研究中心
【摘要】利用SSRHunter软件对现已公布的鲇形目(Siluriformes)中胡鲇科(Clariidae)和鲇科(Siluridea)共2002条EST(Expressed Sequence Tag)序列筛选兰州鲇(Silurus lanzhouensis)微卫星标记,并分析其序列丰度和分布特征。结果共发现209个微卫星序列,占整个ESTs数据库的10.44%;其中三碱基重复序列数量最多,占ESTs数据库中发现微卫星序列总数的35.62%;二、四、五、六碱基重复序列分别占微卫星序列总数的28.31%、25.57%、7.76%、2.74%。根据侧翼序列,设计125对引物,随机选取58对进行扩增鉴定及...
【关键词】兰州鲇(Silurus lanzhouensis) 微卫星标记 表达序列标签(EST) 特征分析
【基金】国家自然科学基金项目(31360633); 宁夏对外科技合作项目
【所属期刊栏目】淡水渔业
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