甘蔗黑穗病菌SCoT-PCR反应体系优化与引物筛选
2015-11-15分类号：S435.661
【部门】华南农业大学农学院/农业部华南地区作物栽培科学观测实验站 华南农业大学农学院/广东省微生物信号与病害防控重点实验室
【摘要】以甘蔗黑穗病菌(Sporisorium scitamineum)交配型菌株基因组DNA为模板,在单因素优化试验的基础上,采用L16(45)正交试验设计,对影响甘蔗黑穗病菌SCoT-PCR反应体系的Mg2+、dNTPs、引物、r Taq DNA聚合酶和模板用量5个因素进行优化,建立优化的甘蔗黑穗病菌SCoT-PCR反应体系:DNA模板12.50ng、dNTPs 0.17mmol/L、引物0.46μmol/L、Mg2+1.7 mmol/L、r Taq DNA聚合酶0.85U、1×Buffer(Mg2+free),总体积25μL。应用优化体系从30条SCoT引物中筛选扩增条带清晰且多态性丰富的10条...
【关键词】甘蔗黑穗病菌 SCoT标记 体系优化 UPGMA聚类分析
【基金】广东省公益研究与能力创新专项(2014A020208094); 华南农业大学人才引进启动资金项目(13009)
【所属期刊栏目】华中农业大学学报
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