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基于定量PCR方法初步分析西藏开菲尔粒中细菌与酵母菌数量变化

2015-07-15分类号:TS252.7

【作者】王兴兴  丁梦帆  潘迎捷  王永杰  
【部门】上海海洋大学食品学院  上海水产品加工及贮藏工程技术研究中心  农业部水产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室  
【摘要】运用实时荧光定量PCR方法分析西藏开菲尔粒中细菌与酵母菌的数量变化规律,需要有效提取其微生物总基因组DNA。本文通过同时添加溶菌酶与溶壁酶优化实验方案,成功获得西藏开菲尔粒中微生物的总基因组DNA。荧光定量PCR分析提取自培养1、4、8和12周的西藏开菲尔粒的微生物总基因组DNA,结果显示:4个时间点细菌16S rRNA与酵母菌26S rRNA基因拷贝数均分别约为每微升107拷贝与105拷贝,表明细菌与酵母菌的数量相对稳定。该结果为进一步研究西藏开菲尔粒中细菌与酵母菌间的共生关系奠定了一定的基础。
【关键词】西藏开菲尔粒  基因组提取  实时荧光定量PCR  数量变化
【基金】上海高校特聘教授东方学者岗位计划基金(20101222); 上海市科学技术委员会科技支撑项目(10540503000); 上海市科委工程中心建设(11DZ2280300)
【所属期刊栏目】上海海洋大学学报
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