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急性病毒性坏死病毒魁蚶株IAP-86基因全长cDNA克隆和生物信息学分析

2015-02-15分类号:S944

【作者】张帅  王崇明  岳志芹  宋晓玲  白昌明  尹伟力  黄倢  
【部门】农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所  山东出入境检验检疫局检验检疫技术中心  
【摘要】为深入探讨急性病毒性坏死病毒(Acute Viral Necrosis Virus,AVNV)魁蚶株的致病机理以及IAP-86蛋白的功能,从感染AVNV的濒死魁蚶外套膜中提取总RNA,反转录获得c DNA。根据NCBI公布的AVNV全基因组序列中ORF86序列设计两对反向套式引物,通过c DNA末端快速扩增(RACE)技术获得ORF86 5?端和3?端的非编码区,拼接获得全长c DNA序列。Blast序列比对显示,该基因与牡蛎疱疹病毒的同源性为100%,与栉孔扇贝AVNV的同源性为99%,并存在重叠基因。生物信息学分析预测,该蛋白不含信号肽,不存在跨膜区,最大疏水指数为1.800,最小疏水指数...
【关键词】急性病毒性坏死病毒  魁蚶  细胞凋亡抑制蛋白  c DNA末端快速扩增技术  生物信息学
【基金】现代农业产业技术体系建设专项(CARS-48); 国家质检总局科研项目(2013IK040)共同资助
【所属期刊栏目】渔业科学进展
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