文蛤生长因子受体结合蛋白2(GRB2)基因克隆、时空表达及SNP位点筛查
2015-09-15分类号:S917.4
【部门】浙江万里学院浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室 上海海洋大学水产与生命学院
【摘要】为探索贝类GRB2基因的结构、功能特征,以及在贝类生长发育过程中的作用,实验通过已构建的文蛤转录组文库,利用SMART RACE技术扩增得到了文蛤GRB2基因的c DNA全长序列,对其生物信息学、组织及发育阶段表达特征进行了分析,并利用直接测序方法在外显子中筛选SNP位点。结果显示,GRB2基因c DNA全长1 791 bp,开放阅读框669 bp,编码223个氨基酸,蛋白由SH-SH2-SH3 3个结构域组成;氨基酸序列比对发现,文蛤G RB2与泥蚶的同源性最高,达到65.6%,与脊椎动物的同源性都在60%以上,说明GRB2基因在进化过程中比较保守。荧光实时定量PCR(qRT-PCR)结果表...
【关键词】文蛤 生长因子受体结合蛋白2(GRB2) 克隆 SNP
【基金】国家自然科学基金(31372527); 国家现代贝类产业技术体系(CARS-48); 浙江省重大科技专项(2012C12907-4)
【所属期刊栏目】水产学报
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